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《南京农业大学学报》(双月刊)创刊于1956年，是南京农业大学主办的综合性农业科学学术期刊，为自然科学版。主要刊登作物遗传育种、生理生态、栽培与耕作，植物病虫草害防治，生命科学，园艺科学，食品科学，动物医学，动物科学，资源与环境科学，农业应用化学及农业工程等学科的研究论文、实验技术、文献综述、科研简报以及反映最新成果的科技快讯。
该刊被以下数据库收录：
《南京农业大学学报》杂志不断发展壮大，现已经成为国内外有一定地位的学术性刊物：
1、收录情况：
国家新闻出版总署收录、中国知网收录、维普期刊网收录、万方数据库收录
CA 化学文摘、哥白尼索引、动物学记录收录、剑桥科学文摘社ProQeust数据库收录
日本科学技术振兴机构数据库、中国科学引文数据库、农业与生物科学研究中心文摘
2、统计源期刊：
中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)
3、核心期刊：
(1)北大核心期刊：
中文核心期刊(2011)、中文核心期刊(2008)、中文核心期刊(2004)
中文核心期刊(2000)、中文核心期刊(1996)、中文核心期刊(1992)
(2)CSCD 核心期刊
(3)中国自然科学核心期刊
4、数据：
DC数据、MARC数据
5、图书馆藏：
国家图书馆馆藏、上海图书馆馆藏
6、期刊荣誉：
中科双效期刊
全国优秀科技期刊
中国自然科学核心期刊
第二届江苏省十佳科技期刊
南京农业大学学报杂志主要栏目：
研究论文、实验技术、文献综述、科研简报、科研快报
南京农业大学学报杂志社已发表论文目录：
1、不同碳氮源对解磷菌K_3溶磷效果的影响虞伟斌;杨兴明;沈其荣;徐阳春;
2、大豆株高QTL定位及Meta分析汪霞;徐宇;李广军;李河南;章元明;
3、伏马菌素B_1人工抗原的鉴定及抗体的制备王莹;郑浩;何成华;张爱华;张海彬;
4、金樱子与2个现代月季品种杂交结实率差异的原因宋杰;王国良;
5、一水肌酸对肉鸭胴体组成及肉品质的影响吴娟;程灵豪;高峰;周光宏;