药剂科的工作之重即为药品管理，要求严格按照《药品管理法》，加强药品质量管理，在保障药品质量的基础上，力争配发药品准确无误。
药品购销工作的相关制度与措施；药剂科药品采购管理的工作制度；药房配发药品避免处方差错防范措施；各配方部岗位职责制度；各药房关于精神药品、麻醉药品、贵重药品管理条例；关于药库药品收发、验收、储存保管、发放制度；药剂科内部领药、退货制度；制剂室各项管理制度、操作规范、安全注意事项。
药品供应管理实行“二级管理”的模式，各部门必须月底盘点，统计，结算，结果上报科里与医院财务部门。
药剂科实行药品的“二级管理”制度：即 药库药品管理为一级管理，各药房药品实行二级管理，部分以电脑网络为基础开展各项工作，有效、客观地为有关部门提供各种数据和信息，同时，医学|教育网搜集整理坚持每月药品盘点和每日处方消耗金额的手工登统计工作，保证药品的管理效益。