辽宁省肛肠医院（暨辽宁中医药大学附属第三医院）是国家卫生部重点肛肠病专科建设单位，国家中医药管理局中医肛肠专业重点学科和重点专科建设单位，中华中医药学会肛肠分会会长单位，中国中医药研究促进会肛肠分会会长单位，医'学教育网|整理国家中医药管理局中医外科肛肠病学优势学科继续教育基地，中华中医药学会全国肛肠专业继续教育基地，国家食品药品监督管理局药物临床试验机构，辽宁省中医药学会肛肠分会会长单位，省、市、铁路医保定点医院、沈阳市商业保险行业协会定点医院，省、市新型农村合作医疗定点医院。
近年来，为满足患者就医需求，完善大学附属教学医院功能，医院在肛肠大专科基础上，又设立皮肤科、骨伤科、口腔科、中医内科、中医外科等科室。医院诊疗设备先进、服务功能完备、中医特色突出，形成了 “大专科、小综合”医疗发展格局。