北京中医医院始建于1956年，是北京市唯一的一所市属综合性、现代化三级甲等中医医院。承担着北京市中医医疗、教学、科研、预防等任务。医院下设北京市中医研究所、北京市中药研究所、北京市国际针灸培训中心、北京市赵炳南皮肤病研究中心。是首都医科大学中医药临床医学院、北京中医药大学教学医院、北京市中医住院医师(全科医生)规范化培训基地。目前，北京中医医院分别被国家中医药管理局评为治未病基地、中医药国际合作基地、中医急诊临床基地、中医适宜技术推广基地、中医药标准化研究推广基地、全国中医医院信息化示范单位，为北京市A类费用免审医疗保险定点医院。
医院占地面积2.7万平方米，总建筑面积5.3万平方米，编制床位565张，实际开放610张，日平均门诊量8000余人次，中医专病门诊70余个，开展中医诊疗技术项目89项，配备大型医疗设备近30种。现有职工1293人。拥有国医大师1人，国家级名老中医30人、市级名老中医19人、全国优秀中医临床人才8人、享受政府特殊津贴21人、北京市新世纪百千万工程市级人选3人、北京市卫生系统“十百千”人才16人、“215”人才14人，北京市中医药人才(125计划)47人。
医院拥有赵炳南皮肤病研究中心、脾胃病中心、肿瘤医疗中心及针灸中心等4个临床诊疗中心。设有中医皮肤科、中医心血管、中医脾胃病、针灸、中医儿科、中医妇科及中医治未病中心7个北京市中医特色诊疗中心。拥有临床科室32个。设有包括肝炎、风湿病、银屑病、红斑狼疮、湿疹、疮疡、周围血管病、乳腺病、乳腺癌、肺癌、干燥综合征、骨质疏松症、不孕症、胃食管反流病、便秘等70多个中医专台，对多种疾病的中医诊疗水平居国内外领先。医院狠抓学科建设和专科建设，积极开展创名院、建名科、树名医活动。目前，医院拥有国家中医药管理局重点学科8个、北京市重点学科5个;国家临床重点专科8个、国家中医药管理局重点专科13个。
医院设立有7个医技科室：检验科、放射科、核医学科、超声诊断科、病理科、营养科、输血科，下设5个二级科室：内窥镜室、纤支镜室、心电图室、肺功能室、呼吸睡眠室。配备大型医疗设备近30种：如核磁共振、CT、ECT、DSA血管机、大型全自动化分析仪、彩色多普勒超声诊断仪等现代化医疗设备。中药房常备中药饮片近600种，诸多院内制剂来源于名老中医及专家的验方、秘方和科研成果，现有批准文号的院内制剂192种，其中中药制剂164种，丸、散、膏、丹、纱条、酊剂、油剂等近20种剂型，70余种为临床常用制剂。
医院承担着本科生、硕士生、博士生的教学任务,现有中医专科教研室12个，拥有8个学科硕士培养点。博士生导师5人、硕士生导师38人。教授、副教授共36人。医院以科技为先导，共获科研成果奖175项，其中省部级以上科研奖73项。