兰州大学基础医学院建有科学研究开放平台，面向校内外开放。实验室面积12000多m2，大型、精密科研实验仪器200多台（件）、设备总价值4000万元。有分子生物学实验室、细胞生物学实验室、免疫学实验室、生物芯片实验室、PCR实验室、电镜室、细胞培养室、生物样品制备室、低温实验室、DNA序列分析室、流式细胞仪室、激光共聚焦显微镜室、核磁共振波谱仪室、显微图像分析室、毛细管电泳仪室、高效液相色谱仪室、原子吸收分光光度计室、血液生化检测室、实验动物质量检测中心等20多个功能实验室和仪器室。
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