《安徽中医药大学学报》（原名《安徽中医学院学报》）是由安徽省教育厅主管、安徽中医药大学主办的综合性中医药学术期刊。国内统一刊号：34-1324/R；国际标准连续出版物号：ISSN 2095-7246。
本刊创刊于1981年12月。试刊2期后，于1982年5月25日经中共安徽省委宣传部批准[皖宣字（1982）022号]成为正式刊物，国内公开发行；1987年改为国内外公开发行。1981－1995年为季刊（每季末月20日出版）；自1996年起改为双月刊（双月1日出版），64页；自2009年第4期页码增加至80页；自2010年第1期内文彩图随文彩色印刷；2011年12底本刊网站开通运行；2012年第4期页码增加至96页；2013年11月12日，经国家新闻出版广电总局同意（新出审字[2013]1414号），由《安徽中医学院学报》更名为《安徽中医药大学学报》。
本刊从1993年起由铅印改为计算机排版，胶印。本刊除早期自办发行外，主要由邮局发行，邮发代号 26-23；国外发行自1989年起交中国教育图书进出口公司代理，国外代号 JNSC-44；1999年下半年起改由中国国际图书贸易总公司代理国外总发行，国外代号 BM6534。本刊读者遍及全国各地，并有部分国外订户。
本刊创刊后即组建了编辑委员会和编辑部。第一届编辑委员会主任委员：李毅；副主任委员：陈可望，高光鉴，刘中本；编委由17人组成。第二届编辑委员会主任委员：高尔鑫；副主任委员：王键；秘书长：马宗华；编委由37人组成。医'学教育网|整理第三届编辑委员会主任委员：王键；副主任委员：彭代银，马宗华；顾问：高尔鑫，刘中本；编委由43人组成。第四届编辑委员会主任委员：王键；副主任委员：彭代银，李泽庚，刘新跃，马宗华；顾问：高尔鑫，刘中本，杨任民；编委由45人组成；还聘请了13位国内知名专家担任特聘编委。学报编辑委员会对学报的发展及编辑出版工作起到指导、监督和咨询作用。
本刊编辑部开始名为编辑室，1993年更名为编辑部。本刊编辑部实行主编负责制。编辑部负责人先后有刘继武（主任）、张笑平（副主任）、王乐匋（主任）、吴沛昌（副主任）、马宗华（主任）、吴达武（主任）、周美启（主任）、姚实林（现任主任），编辑和编务人员先后有刘继武、张笑平、吴沛昌、夏学传、杨永持、马宗华、吴达武、邹守云、姚实林、许霞、曹健、张倩。目前编辑部共有3名专职编辑，均为硕士研究生及以上学历，主编和编辑部主任均为高级职称。
本刊坚持“以提高为主，注重实用，立足安徽，面向全国”的办刊方针，内容上突出中医药特色并体现安徽地方特色。经过对栏目不断调整，目前基本固定的有理论研究、文献研究、新安医学研究、临床研究、临床经验、针灸经络、实验研究、方药研究、教学研究、综述等。其中，新安医学研究等栏目在全国独具特色，深受广大读者欢迎。