第三军医大学药学院，系药学、临床医学博士后流动站，药学博士授权一级学科，生物技术、临床检验诊断学博士授权学科，首批药学硕士专业学位授权点，拥有国家免疫生物制品工程技术研究中心、全军免疫生物制品重点实验室、重庆市药效评价工程中心和国家药物临床试验机构。
现有高级专业技术人员59名，医学|教育网搜集整理其中博士生导师17名、硕士生导师33名，拥有国务院药学学科评议组成员、国家杰出青年基金获得者、全国药理学会抗炎免疫主任委员等领军人才。编设9个教研室和教学实验中心，年招收培养药学、生物技术、临床检验专业本科和硕博士研究生百余人，与重庆市药检所、南川药物种植研究所、上市药企等联建本科生实习基地和药学硕士专业学位实践教育基地，开展本科生国际交流计划、硕博士研究生公派留学计划，首次参加第三届全国医药院校药学/中药学专业大学生实验技能竞赛获“特等奖”。