中国医学科学院北京协和医学院药物研究所成立于1958年，是国家级重点药物研究机构之一。研究所以寻找和研究防治严重危害人类健康的主要疾病的药物为方向，坚持以创制具有自主知识产权的新药为重点，以中草药和天然产物研究为基础，采用现代医药学现代理论和高新技术开展多学科综合性研究。
中国医学科学院、北京协和医学院药物研究所有科技人员300余人，其中正副研究员70余人，中国科学院院士3人，中国工程院院士2人。自国家评选政府特殊津贴以来，我所共有 55人获此殊荣。现有医|学教育网搜集整理“国家级有突出贡献的专家”2名：“卫生部有突出贡献的专家”7 名；被国家人事部等七部委授予首批新世纪百千万人才工程国家级人选 4 名：“协和医科大学特聘教授”3 名；教育部“长江学者”特聘教授 3 名；国家自然科学基金杰出青年基金获得者3名。目前从国内外引进人才共计34名，其中博士后 25人、博士4人、硕士5人，引进人才平均年龄约44岁。 药物研究所以寻找和研究防治严重危害人民健康的主要疾病的药物为方向，坚持以创制具有自主知识产权的新药为重点，以中草药和天然产物研究为基础，采用现代医药学现代理论和高新技术开展多学科综合性研究。新药研究的主要方向为抗肿瘤药物、防治心脑血管病药物、作用于神经精神类疾病的药物和抗老年退行性疾病药物、抗肝炎药物、抗炎免疫类药物、抗糖尿病药物等。