北京中医药大学学报获奖：
1989年获全国高等医药学院校学报编辑质量优秀学报一等奖医学|教育网|搜集整理；
1990年获北京高等学校自然科学学报优秀编辑质量一等奖；
1995年获北京市高校系统自然科学学报优秀学报一等奖；
1995年获国家中医药管理局颁发的全国中医药优秀期刊二等奖；
1996年获中共中央宣传部、国家科学技术委员会、新闻出版署颁发的全国优秀科技期刊三等奖；
2000年获国家中医药管理局颁发的全国中医药优秀期刊一等奖；
2004年获全国高校优秀科技期刊二等奖；
2005、2008年两次获得全国高校科技期刊先进集体称号，2006、2008年两次被教育部科技司评为中国高校精品科技期刊，2009年获得中国高等学校自然科学学报研究会评比的“全国高校科技期刊优秀编辑质量奖”。