北京中医药大学东直门医院医院作为北京中医药大学重要的临床医学院，承担着国内外培养中医临床本科生、硕士生、博士生的临床授课和临床实习任务。自1958年起，培养了近9000名各种层次的高级中医药人才和900余名来自79个国家和地区的外国留学生。近千名国内进修生。同时，医院也不断派学者赴世界各国交流、合作、让中医药走出国门，在世界弘扬中国医学。
医院又是北京中医药大学临床研究所。共设有8个临床研究室，建有Ⅰ级动物实验室、Ⅱ级动物实验室、基础型实验室各一个，应用型实验室两个，基本满足科研教学使用。我院承担了北京中医药大学中医学专业五年制、七年制、台港澳班、留学生临床各专业课程教学及毕业实习教学任务，还承担各专业研究生教育。现有19个临床学科教研室，2个一级学科博士学位授予点，涵盖6个博士学位授权学科点，7个硕士学位授权点。 医'学教育网l整理北京中医药大学第一临床医学院重点学科及重点专科建设卓有成效，现中医内科学为教育部重点学科，中医外科学为北京市重点学科，拥有4个国家中医药管理局重点学科，包括中医内科脑病学科、中医内科内分泌学科、中医内科呼吸学科和中医内科血液病学科。