【红桃k蛋白质粉】蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用

时间:2015-04-02 18:57:36 作者:贾美多;杨闫;张盈盈

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【摘要】:基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该方法的有效性。
【论文正文预览】:生物序列分析是生物信息学的主要研究领域,常常通过比较分析获取有用的信息。传统的序列比较方法是序列比对[1-2],但是利用比对的序列比较假设了同源片段之间是邻接保守的,这和遗传重组相冲突,而且多序列比对在计算复杂性等方面存在困难,这些使得人们致力于研究无比对的序列比
【文章分类号】:Q51
【稿件关键词】:-字母分类模型维向量系统发生分析
【参考文献】:
【稿件标题】:【红桃k蛋白质粉】蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用
【作者单位】:渤海大学数理学院;
【发表期刊期数】:《浙江农业学报》2014年06期
【期刊简介】:《浙江农业学报》杂志是由中华人民共和国新闻出版总署、正式批准公开发行的优秀期刊,浙江农业学报杂志具有正规的双刊号,其中国内统一刊号:CN33-1151/S,国际刊号:ISSN1004-1524。浙江农业学报杂志社由浙江省农业科学院主管、主办,本刊为刊。自创刊以来,......更多浙江农业学报杂志社(http://www.400qikan.com/qk/6050/)投稿信息
【版权所有人】:贾美多;杨闫;张盈盈;李春;


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