化学文摘、哥白尼索引、中国学术期刊(光盘版)、剑桥科学文摘社ProQeust数据库收录
中国科学引文数据库、中国核心期刊(遴选)数据库、农业与生物科学研究中心文摘收录
菌物学文摘(美)、菌物索引(英)、植物病理学文摘(英)、系统菌物学文献目录(英)收录
中国科技信息研究所数据库(CJCR)收录、植物保护文献目录(德)、中国生物学文摘收录
2、核心期刊：
(1)北大核心期刊：
中文核心期刊(2011)、中文核心期刊(2008)、中文核心期刊(2004)
中文核心期刊(2000)、中文核心期刊(1996)、中文核心期刊(1992)
(2)CSCD 核心期刊(2013-2014)(含扩展版)
3、统计源期刊：
中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)
4、数据：
DC数据、MARC数据
5、馆藏：
国家图书馆馆藏、上海图书馆馆藏
6、影响因子：
截止2014年万方：影响因子：1.237；总被引频次：1652
截止2014年知网：复合影响因子：1.665；综合影响因子：1.141
7、期刊荣誉：
自然科学核心期刊
8、偏重的研究方向：
天然药物化学、药物学、医药科学
9、投稿录用比例：100%
10、审稿速度：平均1个月的审稿周期
菌物学报杂志主要栏目：
菌物系统分类学及菌物多样性、菌物资源开发利用、真菌生态及生物防治、菌物共生作用、真菌毒素、致病真菌、菌物学研究的新方法、新技术
菌物学报杂志社已发表论文目录：
1、山东海岸木生海洋真菌的研究Ⅷ杜建建 金静
2、侵袭性真菌病的诊断：现状与展望廖万清 陈敏
3、青檀内生真菌菌群多样性的研究柴新义 陈双林
4、中国西藏黏菌记录（英文）陈双林 闫淑珍 李玉
5、白蚁菌圃真菌多样性研究进展钱茜 李赛飞 文华安
6、中国的膨孢组镰孢菌（英文）赵志慧 吕国忠 姜子德
7、青海黏菌的研究（英文）闫淑珍 刘岐莎 陈双林 李玉
8、中国东北地区玉米纹枯病菌的融合群鉴定李菊 夏海波 于金凤
9、中国南方地区松乳菇遗传多样性分析郭亮 刘君昂 周国英 李河
10、亚侧耳属Hohenbuehelia三个中国新记录种刘宇 图力古尔 李泰辉
11、洪湖沉积物中真菌群落结构的垂直分布赵彦玲 郑世学 方治伟 喻子牛