该刊被以下数据库收录：
《计算机工程与应用》不断发展壮大，现已成为国内外有一定地位的学术性刊物：
1、收录情况：
国家新闻出版总署收录、中国知网收录、维普期刊网收录、万方数据库收录
科学文摘、哥白尼索引、文摘杂志、剑桥科学文摘、乌利希期刊指南(美)收录
JST 日本科学技术振兴机构数据库、CSCD 中国科学引文数据库来源期刊收录
《物理学、电技术、计算机及控制信息数据库》、剑桥科学文摘社ProQeust数据库
2、统计源期刊：
中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)
3、核心期刊：
(1)北大核心期刊：
中文核心期刊(2008)、中文核心期刊(2004)、中文核心期刊(2000)
中文核心期刊(1996)、中文核心期刊(1992)
(2)CSCD 核心期刊
4、数据：
DC数据、MARC数据
5、图书馆藏：
国家图书馆馆藏、上海图书馆馆藏
6、期刊荣誉：
中科双效期刊
电子精品期刊
中国精品科技期刊
中国国际影响力优秀学术期刊
计算机工程与应用杂志主要栏目：
博士论坛、网络、通信与安全、数据库、信号与信息处理、工程与应用
计算机工程与应用杂志社已发表论文目录：
具有广义Hukuhara导数的模糊微分系统的近似解王磊，郭嗣琮
多车场车辆路径问题的改进粒子群算法王铁君，邬开俊
求解最小闭包球问题改进的SMO-型算法丛伟杰，刘红卫
城际铁路线网布局方案比选与软件开发吕明，罗霞，朱海
应急救援中应急物资需求紧迫性分级研究王婧，王海军
鲁棒模型预测控制在变风量空调系统中的应用杨世忠，任庆昌
认知无线电网络中宽频谱的信号分离算法吕守涛，刘健
利用EMD的自适应图像去噪郭耸，顾国昌，李常有，栾方军，宋晓宇
军事工程毁伤评估的组合智能模型袁辉，王凤山
基于BIC与PSO的简约语音识别系统创建包希日莫，高光来，张璟
基于ε-互模拟的软件近似正确性模型马艳芳，陈亮
叶片气动优化仿真数据的数据挖掘应用研究汪伟，莫蓉，张岩
面向多停泊基地的港口拖轮调度优化研究王巍，赵宏，李强
OFDM水声通信降低限幅噪声的改进算法郭铁梁，赵旦峰，钱晋希
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