近年来，医院不断加大投入，积极改善硬件条件，先后购置了64层CT、1.5T核磁共振、γ-刀、X-刀、数字胃肠机、螺旋CT、高压氧治疗舱、超声聚焦刀、乳腺钼钯机、医用直线加速器、DSA、彩超、全自动生化分析仪等万元以上设备700余台（件）。在引进高精尖设备的同时，医院加大对基础设施的投入，投资2亿元建成了高23层、建筑面积43680平方米门急诊综合大楼，该楼配备了先进的仪器设备和智能化管理系统，并配有急救直升飞机停机坪；作为2005年镇江市政府为民办15件实事之一——镇江市儿童医院由我院具体承办，2005年年底挂牌营运；投资近亿元，建筑面积近30000平方米的新区分院新址工程2006年5月投入使用；它的投入使用大大改善了病人的诊疗条件。
与此同时，医院还十分重视专科建设，充分发挥重点科室的龙头作用，注重科技创新，以3个省级临床重点专科（胸心外科、心血管科，神经外科）、7个市级临床重点专科（血液科、泌尿外科、乳房外科、中心实验室、肾内科、综合ICU、影像科）为代表的临床科室，积极开展新技术、新项目，先后开展了心肺联合、心脏、肝脏、骨髓、肾脏等大器官移植术、主动脉置换术、双瓣膜置换加迷宫手术、冠状动脉搭桥术、脑干肿瘤摘除术、脑动脉瘤夹闭术、各种复杂疾病介入术等手术，多项技术填补了镇江市空白，有的达到省内、国内先进水平。近5年来，共有20多项科研成果获市以上科技进步奖，其中省厅级以上5项。