儿科是北京市中医儿科诊疗中心建设单位。综合运用穴位贴敷、中药口服、推拿捏脊等方法治疗厌食，便秘，急、慢性腹泻疗效良好，尤其对迁延性、慢性腹泻具有独特疗效；采用伏九贴敷疗法治疗哮喘、过敏性鼻炎、反复呼吸道感染，取得了良好的临床疗效。
科学研究。建院以来，承担各级课题260项，包括“863”计划、“973”专项、国家“十五”攻关计划、“十一五”科技支撑计划、中医药行业专项、国家自然科学基金等国家级课题83项；获得国家科学技术二等奖3项，省部级科研奖37项（其中北京市科学技术奖9项，国家中医药管理局科学技术奖1项，中华医学科技奖1项，中华中医药学会科学技术奖11项、著作奖10项，中国中西医结合学会科学技术奖5项），其他科研奖22项；获国家专利19项，在核心期刊发表学术论文1168篇，主编出版著作116部。拥有中药药理（骨伤）和生物力学两个国家中医药管理局中医药科研三级实验室及国家中医药管理局筋伤治疗手法重点研究室。承办中国科技核心期刊《中国骨伤》。
特色医疗技术——中西医结合治疗拇外翻技术
中西医结合治疗拇外翻遵循“筋骨并重、内外兼治”的古训，采用微创技术和中医正骨手法与小夹板纸压垫并用的中西医结合治疗原则，形成了规范科学的中西医结合治疗体系，实现了拇外翻疗法的理论创新、技术创新。获2002年国家科学技术进步二等奖。
特色医疗技术——“旋提手法治疗神经根型颈椎病的临床和基础研究及应用”
该项成果继承创新传统旋转手法，建立旋提手法及操作规范；采用多中心随机对照方法，自主研发旋转手法操作力学测量仪、人体压痛力学定量测试仪等，创立一种手法量化考核新模式；建立动态同步髓核内压力测量方法和三维激光脉冲式动态摄像系统；将神经根型颈椎病的传统治疗手法上升到可量化、可重复、适宜推广的科学高度。
特色医疗技术——SARS后骨坏死的证候及中医药治疗（国家科学技术进步二等奖）
做为北京市卫生局指定的“SARS继发骨坏死诊疗专家组”中医组组长单位，参加了SARS后股骨头坏死诊疗方案的制定，以中药多途径为特色的中医治疗方法获得了公认的疗效。做为中医瘟疫研究及其方法体系构建中的重要组成部分，获得了国家科技进步二等奖。
教育教学。医院是中医骨伤科学、中医内科学、中西医结合临床博士点，是中医基础理论、中医骨伤科学、中医内科学、中西医结合临床、针灸推拿学、中西医结合基础硕士点，博士后流动工作站，国家中医药管理局继续教育基地，住院医师规范化培训基地，国家中医药管理局师承教育单位，国家中医药管理局名医工作室，北京市中医药薪火传承“3+3”工程室站建设单位，北京中医药大学临床教学医院。