目前医院配备有各种国际先进的大型检测、诊断、治疗仪器设备，总值超过2亿元，包括有64排螺旋CT，磁共振成像系统，大型数字减影系统，全数字胸部摄影机，医学影像存储及传输系统，全自动生化分析仪，数字化乳腺机，高压氧舱，体外循环机，等一大批高精尖端仪器。
医院在加强学科建设的基础上不断开展高新医疗技术，全院共有20多个研究室，拥有广东省教育厅“中医疑难病证重点实验室”和国家中医药管理局Ⅲ级实验室。近两年各级中标课题为200多项；省部级以上在研科研项目100多项，包括“十一五” 国家科技支撑计划课题“针灸诊疗方案和评价研究”等6项。已获奖的各级科研项目共70多项，其中国家级6项，省级21项。“重症肌无力中医辨证论治研究”和“中西医结合治疗股骨头坏死及其相关疾病的研究”、“脾虚证辨证论证的系列研究”三项获国家科技进步二等奖（在广东省中医医疗机构中排名第一，全省医疗机构中名列前茅，）“中医‘脾-线粒体相关’理论的临床与实验研究”获广东省科技进步一等奖，“输卵管妊娠的临床研究”获中国中西医结合学会科技进步三等奖。
广州中医药大学第一附属医院也是第一临床医学院，共有13个教研室，承担着13000多学时的年课堂教学任务，管理3500多名中医5年本科、中医7年制、5年中西医本科、非医攻博、硕士、博士研究生和博士后等各层次在校学生，是华南乃至全国最大的中医临床教学医院之一。拥有的国家级重点学科4个、国家中医药局重点学科3个及博士后流动站2个。拥有中医妇科学、伤寒论、温病学3门国家级精品课程和中医内科学、中医妇科学、中医骨伤科学、中医眼科学、伤寒论、温病学、金匮要略等7门省级精品课程，中医学专业为教育部第一批高等学校特色专业建设点，第五批国家理科基础科学研究和教学人才培养基地，是省级名牌专业。依托中医临床基础学科，“创立经典教学新体系，升华中医教育新理念”的模式成为广州中医药大学的唯一办学特色。
依托医院所特有的温病教研室（广东独有）的雄厚实力，在2003年抗击“非典型肺炎”的战斗中，我院作为广东省中医治疗非典专家组组长单位，成功采用中西医结合方法治愈70例确诊非典型肺炎病人，并应邀会诊了市八人民医院、中山二院、中山三院、省中医院等37名病人，取得了“抗非”战役的“双零” （零死亡率、零院内感染）战绩，受到省市政府的表彰，中医的疗效受到世界卫生组织专家的赞赏，医院应邀在香港、台湾等地区推广传授“非典”的“综合治疗方案”。“中西医结合治疗气分阶段非典型性肺炎的机理探讨”获得国家自然科学基金唯一中医防治“非典型肺炎”项目。