办学特色：在一百多年的办学历史和五十多年的建校历程中，医学院坚持发扬“海纳百川、博采众长”的优良传统；大力弘扬“博及医源、精勤不倦”的医学院精神。具有临床医学教学条件优裕，临床医学教育和研究相结合；办学模式多元化、人才培养复合型、课程体系多样化、教学方法灵活、积极吸纳国内外先进的办学经验和教学理念的优势和特色。与中国科学院上海生命学院合作成立了健康研究中心，联合开展科学研究。
在国际上：同法国、美国、日本、比利时、澳大利亚、瑞典、香港等19个国家和地区的61所大学及科研机构开展了广泛的合作与交流；聘请了256位外国专家为名誉教授、顾问教授和客座教授；并与世界卫生组织、联合国人口基金会、香港华夏基金会、美国民间健康基金会有着广泛的合作。中法合作办学的临床医学七年制法文班，是中法两国政府的重点合作项目之一。学生在校以法语为第一外语，部分基础课程以法语授课。每年由法方派遣教授来院参与教学。经考核合格者被选送赴法国的医院，作为实习住院医师培训一年。
学院以临床医学教育师资力量强，临床教学条件优越而著称，拥有瑞金、仁济、新华、九院和三院等五所综合性附属医院，上海儿童医学中心一所专科性附属医院，核定总床位数8530张，另有经市教委和卫生局评估合格的13所教学医院。是全国附属医院、教学医院和床位数最多的医学院校。