2009年年底医院收入首次突破亿元大关。
2011年，在医院“十二五”规划的开局之际，医院提出了建设“优势突出、特色鲜明的高水平现代化中医院”的宏伟目标，也是这一年，医院收入首次突破2亿元，实现了跨越式的发展。医院也相继在创建平安医院、群众满意医院、“三好一满意”医院等系列活动中，取得令人满意的成绩。
2011年3月15日，经黑龙江省中医药管理局批准，黑龙江省针灸推拿康复医疗中心正式落户中医大二院。
2011年4月28日，我院治未病体检中心和昌泰大药房正式对外营业。
2011年12月22日，黑龙江中医药大学康复医学院正式成立，划归中医大二院管理。
2013年，医院投资购买征仪路567号房产，筹建跃进社区卫生服务中心。
2013年，医院着手启动在哈南分院建设工作。