2.1 根据课题研究的结论来确定主题 这是常用的方法，可分为：①以科研的结论或部分结论作为医学论文的主题;②科研结果与开题时预测不一致，待查出原因，再寻找主题;③科研达不到预期结果，可总结经验，从反面挖掘主题。
2.2 在科研过程中选题 医学科研的过程中，有时会出现意外的现象或问题，作者如果能够细心观察、及时发现，可以在这些偶然中获得新的选题。
2.3 在临床实践中选题 临床工作是医学论文发表取之不尽的源泉，作者在临床中会经常遇到许多需要解决的实际应用问题或理论问题，对此，只要从本学科实际出发，用心思考，会从中产生很多好的主题。其包括：①探讨发病机制与预后情况;② 分析临床症状与表现;③ 研究诊断方法和治疗方法;④疾病的多因素分析等。
2.4 从文献资料中选题 医学文献是人们长期积累的宝贵财富，是医学论文选题的重要来源。阅读最新文献资料，可以了解当前医学科学研究的进展情况，开拓思路、激发灵感，从而挖掘提炼出好的医学论文主题。