山东法医司法鉴定中心、山东省心脏移植中心及山东省心脏移植与材料工程技术研究中心、山东省肛肠病医院、山东省普外质控中心、山东省病理质控中心、山东省临床营养质控中心、山东省输血质控中心、山东省健康管理质控中心、山东省脑卒中质控中心、山东省肝病会诊中心、山东省先心病诊疗基地、山东省亚健康调理中心、山东省保健“治未病”基地、山东省牙病防治指导中心、山东省口腔保健中心、山东省中医预防保健服务中心、济南市120分中心也附设在该院。
医院同时获得开展心脏、肝脏、肾脏三种器官移植的准入资格，成为全省唯一一家同时获得三种器官移植的医院和全省唯一一家准许开展心脏移植的医院，先后开展了心肾联合移植、肝肾联合移植、心肺联合移植、睾丸移植、眼角膜移植等新技术，多例肝脏移植实现了术中、术后零输血。肾移植患者存活时间最长的25年，并在省级三甲医院中唯一开展骨髓造血干细胞移植，被确立为中华骨髓库造血干细胞定点采集医院。微创腔镜技术与介入诊疗技术是医院特色技术品牌。
医院拥有美国瓦里安Truebeam直线加速器、德国西门子Skyra 3.0T智能磁共振成像仪、美国GE Discovery宝石高清能谱CT、数字化平板心血管影像系统、平板数字高清胃肠仪、德国罗氏Synphilin染色封片一体机、高档彩色B超、全自动生化分析系统等世界顶尖的医疗设备。
医院省内率先推行“无陪护”服务模式，积极推进优质护理服务，是卫生部首批优质护理服务示范医院，被卫生部评为首批优质护理服务考核优秀医院。
医院着力推行夏季弹性工作制与无假日专家门诊，通过优化工作流程为患者就诊提供最大便利；不断完善的科室综合目标管理体系、绩效考核与成本核算体系，推动了医院健康快速发展；大力加强人才队伍建设，遴选出一批优秀中青年业务骨干进行重点培养，为医院发展奠定了坚实的人才基础。
医院先后与禹城县人民医院、新疆石河子大学医学院一附院、青海海北州第二人民医院等10家医院建立了对口支援关系，定期派专家前去工作医|学教育网整理。在此基础上，医院还与枣庄市立医院、山东省警官总医院等50余家医院签署了全面合作协议，逐步形成了以技术服务为核心、各种医疗资源优势互补的健康服务链，同时探索集团化建设，联合齐鲁石化中心医院、曹县人民医院等5家地市医院成立了山东省千佛山医院集团，促进优质医疗资源纵向流动。医院定期派专家到合作医院进行业务讲座、门诊及手术指导等，免费接收基层医院进修人员，经常举办针对合作医院的业务技术交流，免费为合作医院安装绩效系统与病理远程会诊系统，培训管理人员。